MongoDB是一款流行的面向文檔的開源數據庫，由C++語言編寫，被廣泛用于儲存大型數據集和復雜的數據變化性。然而，MongoDB并不是完美的，它有一些缺陷，在使用它時必須知道這些限制。

首先要說明的是MongoDB在ACID事務方面缺乏強大功能。在它中，只有單點（document）寫入操作是原子性的，而多點（multiple documents）寫入操作卻不是，這限制了它在更復雜的數據處理場景中的應用。為了解決這個問題，MongoDB提供了一種名為“多文檔事務”的功能，它可以確保多個文檔的原子性操作，但是這是一種限定性的事務，而且只能在同一個集合內實現：

//MongoDB事務
db.collection.startTransaction({
  readConcern: { level: 'snapshot' },
  writeConcern: { w: 'majority' },
});
try {
   db.collection.insert( { _id: 1, value: 'one' } );
   db.collection.update( { _id: 1 }, { value: 'two' } );

   db.collection.commitTransaction();
} catch (e) {
   db.collection.abortTransaction();
   throw e;
}

其次，MongoDB的查詢性能也是一種缺陷，主要查詢性能是由于缺乏有效的索引。特定文檔的檢索非常快，但是在查詢大型集合時，索引可以提升查詢性能。MongoDB支持單層索引和多層索引：

//MongoDB索引
db.collection.createIndex( { 
    field1: 1,
    field2: -1,
    field3: '2dsphere'
} )

此外，MongoDB僅支持單個數據中心的部署，在數據復制時，沒有對抗網絡分區的能力，也無法確保多點分布式數據的強一致性。為了解決這個問題，MongoDB提供了一種名為“復制集”的功能，允許客戶端將多個節點配置為集群，從而確保數據的強一致性：

//MongoDB復制集
rs.initiate({
  _id: "mongodb_set",
  members: [
    { _id: 0, host: 'host1:27017' },
    { _id: 1, host: 'host2:27017' },
    { _id: 2, host: 'host3:27017' }
  ]
});

綜上所述，MongoDB確實有一些缺陷，但是它也提供了一些功能（如多文檔事務和復制集）來解決這些缺陷。因此，在使用MongoDB時，開發人員必須正確理解并利用這些功能，以確保數據的正確性和安全性。